Luigi Ricciardi 1 Rosa Mazzeo 2,*©, Angelo Raffaele Marcotrigiano 1 , Guglielmo Rainaldi 3 , Paolo Iovieno 4 , Vito Zonno 1 Stefano Pavan 1© û Concetta Lotti 2,*
- 1 Beşa Zanistên Axê, Nebat û Xwarinê, Genetîka Nebatan û Yekîneya Nûjînê ya Bari, Via Amendola 165/A, 70125 Bari, Italytalya; luigi.ricciardi@uniba.it (LR);angelo.marcotrigiano@uniba.it (BIÇEKKIRIN); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 Beşa Zanistên Çandinî, Xwarin û Jîngehê, Zanîngeha Foggia, Via Napoli 25, 71122 Foggia, Italytalya
- 3 Beşa Zanistên Biyolojîk, Biyoteknolojî û Biyodermaceuticals, Zanîngeha Bari, Via Orabona 4, 70125 Bari, Italytalya; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 Beşa Teknolojiyên Enerjiyê, Biyoenerjî, Biorefinery û Beşa Kîmyaya Kesk, Navenda Lêkolînê ya ENEA Trisaia, SS 106 Ionica, km 419+500, 75026 Rotondella (MT), Italytalya; paolo.iovieno@enea.it
* Lihevhatinî: rosa.mazzeo@unifg.it (RM); concetta.lotti@unifg.it (CL)
Veqetî:
Pîvaz (Allium cepa L.) li çaraliyê cîhanê duyemîn çandiniya nebatî ya herî girîng e û ji ber feydeyên xwe yên tenduristiyê pir tê pejirandin. Tevî girîngiya wê ya aborî ya girîng û nirxa wê wekî xwarina fonksiyonel, pîvaz ji ber cihêrengiya xwe ya genetîkî kêm nehatiye lêkolîn kirin. Li vir, me guhertoya genetîkî ya di "pîvaza sor a Acquaviva" (ARO) de lêkolîn kir, nijadek ku xwedî dîrokek sedsaliya çandiniyê ye li bajarokek piçûk li parêzgeha Bari (Apulia, başûrê Italytalya). Komek ji 11 nîşankerên mîkrosatelîtê ji bo vekolîna guhertoya genetîkî ya di berhevokek germplasmê de ku ji 13 nifûsa ARO û sê celebên bazirganî yên hevpar pêk tê, hatin bikar anîn. Analîzên strukturên genetîkî yên bi rêbazên parametrîk û ne-parametrîk ronî kirin ku ARO jenosîdek baş diyarkirî temsîl dike, ku bi zelalî ji nijadên Tropea û Montoro yên ku ew bi gelemperî bi xeletî tê de têne cûda cûda ye. Ji bo danasîna ampûlên ku bi gelemperî ji bo vexwarina nû têne bikar anîn, naveroka zexm a çareserker û tûj hatin nirxandin, ku di ARO de şêrîniya bilindtir bi rêzgirtina her du nîjadên jorîn ên jorîn nîşan dide. Bi tevayî, lêkolîna heyî ji bo nirxkirina paşerojê ya ARO-yê bikêr e, ku dikare bi navgîniya etîketên kalîteyê ve were pêşve xistin ku dikare bibe alîkar ku xapandinên bazirganî sînordar bike û dahata xwedan piçûk baştir bike.
Pêşkêş
Cinsê Allium bi qasî 750 cureyan [1] dihewîne, di nav wan de pîvaz (Allium cepa L., 2n = 2x =16) yek ji wan celebên herî berbelav e. A. cepa xwedan çerxek dusalane ye û behremendiya zayînê ya li derva ye. Naha, hilberîna gerdûnî ya pîvazê (97.9 Mt) ew dike duyemîn çandiniya herî girîng a zebzeyan piştî tomato [2]. Ji demên berê ve, ampûlên pîvazê hem wekî xwarin û hem jî di dermanên gelêrî de têne bikar anîn. Bi rastî, Misiriyên kevnar berê gelek formulên dermankirinê li ser bingeha karanîna sîr û pîvaz di papîrusek bijîjkî ya 1550 BZ de, Codex Ebers [3] ragihandine.
Ev sebzeya piralî û tendurist xav, teze, an wekî hilberek hilberkirî tê vexwarin û ji bo xweşkirina tama gelek xwarinan tê bikar anîn. Gelek lêkolînên vê dawiyê îdîa dikin ku vexwarina pîvazê dibe ku xetera nexweşiyên dil [4,5], qelewbûn [6], şekir [7], û cûrbecûr cûrbecûr penceşêrê kêm bike [8-10]. Taybetmendiyên tenduristiya pîvazê bi gelemperî ji astên bilind ên du çînên pêkhateyên nutraceutîkî têne hesibandin: flavonoids û alk (en)yl cysteine sulphoxides (ACSO). Di çîna yekem de flavonols û anthocyanins hene. Quercetin flavonolê sereke yê tespîtkirî ye, ku ji ber taybetmendiyên xwe yên antîoksîdan û antî-înflamatuar ên bihêz di hilgirtina radîkalên azad û girêdana îyonên metal ên veguhêz de tê zanîn. [11]; lê belê antocyanîn rengê sor/binefşî dide hin cureyên pîvazê. Ji bo ACSO, ya herî zêde isoalliin e [(+)-trans-S-1-propenyl-L-cysteine sulfoxide] [12], amîno asîdeke sulfurê ya nehilber û ne proteînogenîk e ku di nav şaneyan de tê hilanîn, ku nerasterast berpirsiyarê bîhn û tama pîvazan e. [13]. Li ser qutbûna tevnvîsê, isoalliin ji hêla enzîma alliinase ve tê perçe kirin û rêzek pêkhateyên guhezbar (pyruvate, ammonia, thiosulphonates û propanethial S-oxide) çêdike, ku hêstiran çêdibe û dibe sedema bêhnek ne xweş (tûj). [14]. Tenduristiya pîvazê bi gelemperî wekî mîqdara, her gramek giraniya nû, asîda pîrûvîk a ku ji hêla hîdrolîzê ve hatî hilberandin tê pîvandin. [15,16].
Li welatên deryaya Navîn, wekî yek ji navendên cihêrengiya duyemîn tê pêşniyar kirin A. cepa [17,18], ampûlên pîvazê di şekl, mezinahî, reng, maddeya hişk û tûjiyê de guherbarek berfireh nîşan didin [19-yek]. Digel vê yekê, zibilkirina li ser sulfur, pratîkên agronomîkî, celebê axê, şert û mercên avhewa, û jenotîpa kulîlkan an jî zevî dikarin bi danasîna nirxên organoleptîk û xwarinê yên taybetî bandorê li kalîteya gulikê bikin. [23-yek]. Li Îtalyayê, tevî hebûna germplazma pîvazê ya berfireh, tenê çend celebên pîvazê bi gelemperî di lêkolînên zanistî de têne kirin û bi rêkûpêk têne diyar kirin. [28,29].
Taybetmendiya bi tevahî genetîkî û fenotîpîkî ya pirrengiya çandiniyê ji bo misogerkirina parastina guncan a çavkaniyên genetîkî yên nebatan û pêşxistina karanîna genotipên taybetî di zincîra nirxê de girîng e. [30-yek]. Nîşankerên dubarekirina rêzika hêsan (SSR) bi gelemperî ji bo nexşeyê hatine hilbijartin [33-yek], Şopa tiliyên DNA û cudakirina çandê [36-yek], û texmîna pêbawer a guherbariya genetîkî di hundur û di nav nijadan de [39-yek], ji ber ku ew lokûsên taybetî, pir-alelîk in, bi codominant mîras in, pir têne hilberandin û ji bo genotipkirina otomatîkî minasib in.
Di lêkolîna heyî de, me bala xwe da ser zevîyek kevneşopî ya Apulî, "pîvazê sor Acquaviva" (ARO), ku li gorî rêbazên çandiniya organîk li herêmek piçûk a bajarokê Acquaviva delle Fonti, li parêzgeha Bari, tê çandin. (Apulia, Îtalya Başûr). Kulîlkên vê nîjada zevî mezin û pêçandî û rengê sor in û bi giranî di xwarinên herêmî de têne bikar anîn. Her çend ARO nîşana kalîteyê "Slow Food Presidium" stend, lê hilberîna wê dikare ji hêla nîşaneyên kalîteyê yên Yekîtiya Ewropî ve wekî nîşana erdnîgariya parastî (PGI) û navnîşa xwerû ya parastî (POD) ve were pêşve xistin û were parastin, ji ber ku ev dikarin bibin alîkar ku meriv bi sînor bike. sextekariyên bazirganî û baştirkirina dahata xwediyên piçûk. Li vir, nîşankerên molekulê yên SSR wekî amûrên hêzdar hatin bikar anîn da ku guheztina genetîkî di nav nifûsa ARO de binirxîne û vê nîjadê ji du nîjadên din ên pîvazê sor ên Italiantalî cuda bike. Digel vê yekê, me ji bo ku tama ARO-yê bi daxwaziya bazarê re têkildar binirxînin, hişkbûn û naveroka zexm a çareserker texmîn kirin.
results
Damezrandina Acquaviva Pîvaza Sor a Germplasm û Taybetmendiya Morfolojîk
Tovên 13 nifûsa xwezaya ARO, ku ji hêla cotkaran ve di çarçoveya projeya BiodiverSO Herêma Apulia de hatine dayîn, ji bo avakirina berhevokek germplazma ARO hatin bikar anîn.
Danasîna morfolojîk, ku bi gul, çerm û goşt ve girêdayî ye, li ser germplazma ARO û li ser sê nîjadên pîvazê, du ji nîjada "Pîvaza sor a Tropea" (TRO) û yek jî ji nijada "pîvaza sifir a Montoro" (MCO) hatine berhev kirin (Wêne. 1). Hemî ampûlên ARO xêz bûn û bi çerm û goştê derveyê sor ên bi rengên cûda yên sor ve têne xuyang kirin. Berevajî vê, goştê ampûlên TRO bi tevahî sor bû, lê goştê ampûlên MCO kêm pigment bû (Tablo S1). Analîzên biyokîmyayî destûr da ku meriv naveroka zirav û hişkbûnê binirxîne. Wekî ku di tabloyê de hate ragihandin 1, Nirxên navînî yên naveroka zexm ên çareserker ên ampûlên di nifûsa ARO de 7.60 bû, û ji 6.00 (ARO12) heya 9.50 ° Brix (ARO11 û ARO13) bû. Ev nirx ji ya ku ji bo zeviyên TRO û MCO (bi rêzdarî 4.25 û 6.00 ° Brix) tê texmîn kirin bilindtir bû.
Table 1. Naveroka Soyîn û Nirxên Tenduristiyê Di Nifûsên "Pîvaza Sor a Acquaviva" (ARO), "Pîvaza Sor a Tropea" (TRO), û "Pîvaza Sifir a Montoro" (MCO) de hatine nirxandin *.
NAVÊ DIZÎ | Naveroka hişk a çareserkirî (Brix) | Tûjbûn (pmolg-1 FW) | ||
Dilxerab | CV y (%) | Dilxerab | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 ab * | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | 6.51 to | 22.98 |
ARO3 | 7.50 BCD | 9.42 | 5.28ab | 22.88 |
ARO4 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.97 to | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.80 to | 9.68 |
ARO6 | 6.25 D | 5.65 | 4.51ab | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25ab | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | 7.04 to | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | 6.84 to | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94ab | 6.57 |
ARO11 | 9.50 A | 7.44 | 5.54ab | 16.43 |
ARO12 | 6.00 D | 0.00 | 4.91ab | 9.70 |
ARO13 | 9.50 A | 7.44 | 6.63 to | 24.93 |
MCO | 6.00 D | 0.00 | 4.18ab | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 b | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28ab | 4.79 |
* Wateya bi tîpên heman tîpên mezin an piçûk bi rêzê ve di 0.01P an 0.05P de ji hêla îstatîstîkî ve cûda ne (Testa SNK). y Coefficient of variation.
Nirxa navînî ya tûjbûna ARO, ku bi naveroka asîda pîrûvîk ve hatî nirxandin, 6.00 bû, ji 4.51 pmol g bû.-1 FW (ARO6) ber 7.04 (ARO8). Ev nirx ji ya ku di zeviyên TRO û MCO de tê texmîn kirin (3.54 pmol g-1 FW û 4.18 pmol g-1 FW, bi rêzê).
Polîmorfîzma SSR û Têkiliyên Genetîkî yên Di nav Têketinê de
Di lêkolîna heyî de, 11 ji 37 kombînasyona SSR-ya primera testkirî, polîmorfîzma yek-locus peyda kirin, ango, herî zêde du hilberên amplifikasyonê di kesek yekane de didin. Bi tevayî, 55 alel di 320 kesan de hatin tesbît kirin ku di serê locusê de jimareyek alel ji 2 (ACM147 û ACM 504) heya 11 (ACM132) û nirxek navînî 5 alel in (Table 2). Di nifûsa kesane de, hejmara alel (Na) ji 1.94 (ACM147 û ACM504) heya 5.38 (ACM132) bû, lê jimara bandorker a alel (Ne) ji 1.41 (ACM152) heya 2.82 (ACM449) bû. Nakokîyên di navbera nirxên Na û Ne de ji ber hebûna alelên bi frekansa kêm di nav gelan de û serdestiya tenê çend alelan bû. Nirxa heterozygosity (Ho) ya herî zêde ya dîtbar ji bo ACM138 û ACM449 (0.62) hate destnîşan kirin, lê ya herî jêrîn bi ACM152 (0.25) re têkildar bû. Heterozîgosîteya çaverêkirî (He), ku bi bendewariya teorîkî ve di nifûsek panmiktîk de têkildar e, ji 0.37 (ACM504) heya 0.61 (ACM132, ACM138, û ACM449) bû. Indeksa rastkirinê ya Wright (Fis), ji bo hemî nîşankeran nirxên nêzî sifirê (navînî 0.05) nîşan dide, nirxên wekhev di navbera astên heterozîgosîteyê yên dîtbarî û yên bendewar de nîşan dide, wekî ku ji bo celebek derbazkirî tê hêvîkirin. Karbidestiya nîşana SSR ya kesane di tiliya tiliya genetîkî de ji hêla navnîşa agahdariya polîmorfîk (PIC) ve, bi nirxek navînî 0.48 û ji 0.33 (ACM504) heya 0.67 (ACM132) hate texmîn kirin. Indeksa karîgeriyê ya din, Indeksa Agahdariya Shannon (I) nirxek navînî 0.84 nîşan da, û nirxan texmîn kir ku ji 0.45 (ACM152) heya 1.20 (ACM132) diguhere.
Table 2. Taybetmendiyên Polîmorfîzmê yên 11 Nîşankerên SSR-ê yên ku ji bo Texmînkirina Cihêrengiya Genetîkî di ARO, TRO, û nifûsa MCO de têne bikar anîn. Hejmara Tevahiya Alêlan (Na), Rêjeya Mezinahiya Bandê, û Endeksa Naveroka Agahdariya Polîmorfîk (PIC) Ji Tevahiya Tevahiya 320 Kesên ku di vê Lêkolînê de Jenotîp hatine kirin binihêrin. Hejmara Alelan (Na), Hejmara Alelên Bibandor (Ne), Heterozîgosîteya Çavdêrî (Ho), Heterozîgosîteya Hêvî (He), Endeksa Teqandinê (F)is), û Endeksa Agahdariya Shannon (I) vedigire Nirxên Navîn ên Ji 16 Nifûsan Hatî Hesabkirin, Her Ji hêla 20 Kesan ve Hatiye Hesabkirin.
Locus. | Bi tevahî Na | Rêjeya Mezinahiyê (bp) | PIC | Dilxerab | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
Dilxerab | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
Di nav nifûsê de, ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, û MCO asta bilind a guhertoya genetîkî nîşan dan (Ho > 0.5), lê cihêrengiya herî kêm di nifûsa ARO7 de (Ho = 0.27) hate dîtin (Tabloya Pêvek S2). Bi tevahî, hemî tevlêbûnên Fis nirxên nêzîkî sifirê (Fis nirxa navîn = 0.054), wekî ku di bin şert û mercên hevberdanê de tê hêvî kirin.
Analysis of Molecular Variance and Genetic Structure
Dabeşkirina hîyerarşîk a guhertoya genetîkî di nav û di nav nifûsê de ji hêla AMOVA ve hate hesibandin. Encam beşek girîng a cûdahiya genetîkî di nav gelan de (87%) ronî kir. Cûdahî di nav nifûsê de, 13%, pir girîng bû (P < 0.001) (Tablo 3). Nirxên hevûdu yên parametreya Fpt, analojek nîşana rastkirina Fst ya Wright, ku ji 0.002 (ARO2 / ARO10) heya 0.468 (ARO7 / TRO2) diguhere, girîng bûn (P < 0.05), ji bilî neh berhevokên cot (Tabloya Pêvek S3).
Table 3. Analîza Varîansa Molekulî ya 320 Genotîpên ji 16 Nifûsa allium cepa L.
Kanî | df | Sum of Squares | Texmîna Variance | Variance (%) | Fpt | P |
Di nav gelan de | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
Di nav gelan de | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
Hemî | 319 | 2731.62 | 8.66 |
Lêkolîna avahiya genetîkî ya li A. cepa berhevoka jenotîp a di vê lêkolînê de bi riya analîza kombûnê-based modela tevlihevkirinê ya ku di nermalava STRUCTURE de hatî bicîh kirin hate kirin. Rêbaza Evanno AK ji bo me dabeşkirina du koman (K = 2) pêşniyar kir. databas,bi the piştî bilindtirîn peak li K = 5 (suplementaiv Rgure S1). YEK ji bo K = 2, ahpopulations were assigned to onûf du kom bi hevsengek rnernbertoip (q) > 0.7. Wek shown di jimar 2a, koma yekem (navê S1) MCO û hemî nifûsa ARO dihewîne, lê koma S2 du nifûsa TRO kom dike. Li K = 5, danasînek kûr a databasê peyda dike (Wêne 2b), 75% ji beşdaran li yek ji pênc koman hatine destnîşankirin. Cûdahiya di navbera ARO (S1) û TRO (S2) de hate pejirandin, her çend hin nifûsa ARO hatin tevlihev kirin (q <0.7) an jî di du komên nû S3 û S4 de (bi rêzdarî ARO7 û ARO12) veqetandî kom bûn. Balkêş e, celebê bazirganiya MCO komek cihêreng (S5) ji pîvaza sor a Apulyayê veqetand.
Têkiliyên Genetîkî di nav gelan de
Polîmorfîzma SSR destûr da ku dendrogramek cihêrengiya genetîkî xêz bike û encamên analîza fîlogenetîkî di Figure de têne destnîşan kirin. 3a. Li vir, berhevoka germplasmê li pênc koman hate dabeş kirin ku ji hêla nirxên bootstrap ve bi hêz têne piştgirî kirin. Nifûsa ARO7 û ARO12 tavilê ji nifûsa mayî hatin veqetandin û du komikên cihêreng ava kirin. Koma sêyem du nifûsa bazirganî ya TRO vedihewîne, di heman demê de girêka çaremîn MCO ji yanzdeh nifûsa ARO dabeş kir. Têkiliya genetîkî ya ku di nav nifûsê de pêk tê bi riya analîza hevrêziya sereke (PCoA) bêtir hate lêkolîn kirin (Wêne 3b). Wekî ku berê hate ronî kirin, nifûsa ARO bi tundî hatine kom kirin, ji bilî ARO12 û ARO7, ku di pilana PCoA de di pozîsyonên veqetandî de xuya bûn. Du TRO û nifûsa MCO di panela jêrîn-rastê ya komployê de belav bûn.
3. Cihêrengiya genetîkî di nav 16 de A. cepa nifûsên ku di vê lêkolînê de têne diyar kirin, li ser bingeha profîla SSR-ya wan. (a) UPGMA dendrograma dûrbûna genetîkî. Nirxên piştgiriya Bootstrap> 50 li jor girêkên têkildar têne destnîşan kirin; (b) analîzkirina pêkhateya sereke (PCoA). Grûba bi rengê sor bi tevahî bi koma ku ji hêla analîza fîlogenetîkî ve hatî çêkirin û ji hêla 11 tevlêbûna ARO ve hatî çêkirin re hevaheng e.
Nîqaş
Di nav rêjeyek mezin agro-biodorîteya ku bi kevneşopî li başûrê Italytalya tê çandin, zevîyên pîvaz hilberên pîvaz temsîl dikin ku hewce ne ku ji xetereya erozyona genetîkî û xetera cîhgirtina ji hêla cotkarên nûjen ve werin parastin. Di çarçoveya projeya herêmî ya BiodiverSO de, ku bi mebesta komkirin, taybetmendîkirin, pêşvebirin û parastina çavkaniyên genetîkî yên herêma Apulia ku bi mîrata herêmî ve girêdayî ye, me berhevokek tov a ji 13 nifûsa nijada ARO ava kir. Me nirxandina yekem a guhertoya ARO di warê polîmorfîzma DNA û du pîvanên biyokîmyayî de, naveroka asîda hişk û pîrûvîk a çareserkirî, bi taybetmendiyên tamê ve girêdayî ye û ji bo pejirandina hilberên nû yên nepiştî girîng e, ragihand. Wekî din, daneyên li ser erdnîgariya ARO bi yên ku li ser du nîjadên din ên pîvazên pîgmentî yên ku pir caran bi wan re xelet bûne hatine berhev kirin.
Li gorî rêwerzên pîşesaziya pîvazê şîrîn, analîzên biyokîmyayî şêrîniya 13 nifûsa ARO-yê, ku bi naveroka zexm a zirav û tûjbûna navîn ve girêdayî ye, ronî kir. [31]. Lampikên ARO ji yên zevîyên TRO û MCO şêrîntir bûn, û tîrêjek hinekî bilindtir nîşan dan. Lêbelê, şîrîniya pîvazan ji ber hevsengiyek di navbera naveroka şekir û tûjiyê de ye, ji ber vê yekê ev taybetmendî dikare ji bo piştgirîkirina hilbijartina jenotîpên nirxê, ku bi gelemperî ji hêla cotkaran ve tenê li ser bingeha morfolojiyê têne kirin, kêrhatî be.
Nîşaneyên SSR-ê hate pejirandin ku amûrek bikêr e ji bo cûdakirina genotip, her çend di nav deverek mezinbûna teng de wekî bajarê Acquaviva delle Fonti hatî berhev kirin. Nîşaneyên hilbijartî ji wan nîşankerên ku berê ji hêla wan ve hatine ragihandin jimarek alel zêdetir nîşan didin [43] û [44], lê ji nîşankerên ku ji hêla ve hatî ragihandin kêmtir [45]. Digel vê yekê, 50% ji koma nîşankeran nirxên PIC-ê ji 0.5-an mezintir nîşan dan, wekî ku ji hêla pêşniyarê ve ji bo cûdakirina nifûsa di berhevokê de maqûl e. [46]. Nirxandina cihêrengiya di nav nifûsê de nirxên wekhev di navbera Ho û He de eşkere kir, ku di encamê de Fi kêm bûs nirxên. Ev bi xwezaya der-derbasbûnê re lihevhatî ye A. cepa, ku bi giranî ji depresyona hevjîniyê dikişîne [47]. Bi giştî Fis nirxa ku di nifûsa pîvazê de di vê lêkolînê de hatî hesibandin (0.054) ji ya ku berê ji hêla hatî ragihandin kêmtir bû. [45] (0.22) û hema hema bi ya ku ji hêla ve hatî dîtin yek e [31] (0.08) û [48] (0.00) yê ku cihêrengiya genetîkî di nîjadên pîvazê de ji bakurê rojavayê Spanya û Nîjer, bi rêzê nirxand. Asta balkêş a heterozygosity di nifûsa ARO de têgîna ku Apulia ji bo gelek celebên baxçevanî navendek cihêrengiyê temsîl dike xurt dike. [32, 42, 49-yek].
AMOVA ronî kir ku piraniya guhertoyên molekulî yên di berhevoka jenotîpa di vê lêkolînê de di nav gelan de ye. Lêbelê, cihêrengiya genetîkî ya girîng di nav gelan de (FPT nirx) rûdana stratebûna genetîkî eşkere kir. Di rastiyê de, her çend encamên me hebûna yekrengiya genetîkî di piraniya nifûsa ARO de destnîşan kir, ku komek baş-rêveberî ava dike, nifûsa ARO7 û ARO12 profîlek genetîkî ya zelal eşkere nîşan didin. Dibe ku ev encam ji ber eslê cûda yên tovên ku ji hêla du cotkarên ku nifûs jê hatine berhev kirin ve hatî bikar anîn be. Digel vê yekê, li ser bingeha encamên ku hatine bidestxistin, nijada ARO dikare di asta genetîkî de ji zevîyên TRO û MCO bi eşkere cûda were hesibandin. Di lêkolîneke dawî de, [29] cihêrengiya genetîkî ya çend nîjadên pîvazên Italiantalî yên wekî "Acquaviva", "Tropea" û "Montoro" nirxand. Her çend nivîskaran nîşankerên SNP bikar anîn da ku cihêrengiya genetîkî ya berhevokek berfireh a pîvazê binirxînin, genotyping nekare "Acquaviva" ji pîvazên "Tropea" û "Montoro" cuda bike. Dibe ku, ev cûdahî ji ber nirxa PIC-ê ya kêm a ku hatiye dîtin (0.292) ye, ku agahdariya gelemperî ya hûrgelê ya di binê analîzê de wekî ku ji hêla tê îdîa kirin pêşniyar dike. [29]. Wekî din, ji bo vekolîna hebûna binesaziyê di koma wan a Italiantalî de, çêtir bû ku jenotîpên Italiantalî ji berhevokê cuda cuda werin analîz kirin. Dibe ku wê bihêle ku di bin hilbijartina ampîrîk de şêwaza cihêrengiya genetîkî ya ku bi stratejiya erdnîgarî an taybetmendiyên xwe ve girêdayî ye xuyang bike.
Di encamnameyê de, lêkolîna heyî raporek berfireh li ser zevîyek pîvazek ku bi mîrateya çandî ya herêmî ve girêdayî ye û ji bo cotkaran girîngiya aborî ye nîşan dide. Encamên me ronî dikin ku, ji bilî çend îstîsnayan, ARO ji hêla jenosîdek baş-rêveberî ve tête diyar kirin, ku heq dike ku ji xetereya erozyona genetîkî were parastin. Ji ber vê yekê, damezrandina berhevokek nûnerê vê çavkaniya hêja ya cihêrengiya genetîkî pir girîng e. Di dawiyê de, taybetmendiya genetîkî û fenotîpîkî ya ARO dibe ku ji bo bidestxistina nîşanên kalîteyê ji Yekîtiya Ewropî kêrhatî be.
Alav û Rêbaz
Berhevkirina Germplasm, Materyalên Nebatan, û Derxistina DNA
Di çarçoveya projeyek Herêma Apulia de (BiodiverSO: https://www.biodiversitapuglia.it/), bi riya rêzek mîsyonên ku li "Acquaviva delle Fonti", bajarokek piçûk a Pulyayî ya li parêzgeha Bari, Italytalya, hatine kirin. Cihên berhevkirina her endaman bi navgîniya Pergala Agahdariya Erdnîgarî (GIS) ve hatine nexşekirin û di Tabloyê de hatine ragihandin 4. Wekî din, du nifûsa ji axa TRO û yek nifûsa ji nijada MCO di lêkolîna heyî de cih girtin û wekî referans hatin bikar anîn. Hemî materyalê nebatê di heman şert û mercên hawirdorê de li çandiniya ceribandinê "P Martucci" ya Zanîngeha Bari (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E), di bin qefesa parastinê de hate mezin kirin da ku di nav de poşmaniya xaçê dûr nekevin. nifûs û misogerkirina poşmankirina nav-nifûsê bi rêya bilbilan (Lucilia caesar). 16 nifûs ji bo taybetmendiyên ku bi mezinahî û şikil û rengê çerm û goşt ve girêdayî ne hatine destnîşan kirin (Table S1). Digel vê yekê, ceribandina naveroka hişk a hişk bi karanîna refraktometreyek destan hate kirin û di nimûneyên ava pîvazê de pîvaz hate pîvandin ku 2,4-dinitrophenyl hydrazine (0.125% v/v di 2N ya HCl de) û vegirtinê li 420 nm dinirxîne, wekî ku ji hêla [31]. Testa pir-range ya Duncan û ceribandina SNK-ê hate kirin ku hebûna cûdahiyên girîng diyar bike.
Table 4. Lîsteya nifûsên ku di vê lêkolînê de hatine berhevkirin û jenotîp kirin. Ji bo her nifûsê, Koda Nasnameyê, Navê Herêmî, Koordînasyona GPS, û Bankeya Genê ya Parastina Tovan têne rapor kirin.
Navê dizî | Nav | Koordînatên GPS | Gene Bank y |
ARO1 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | Di.SSPA |
ARO2 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | Di.SSPA |
ARO3 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | Di.SSPA |
ARO4 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | Di.SSPA |
ARO5 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | Di.SSPA |
ARO6 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | Di.SSPA |
ARO7 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | Di.SSPA |
ARO8 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | Di.SSPA |
ARO9 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | Di.SSPA |
ARO10 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | Di.SSPA |
ARO11 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | Di.SSPA |
ARO12 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | Di.SSPA |
ARO13 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | Di.SSPA |
TRO1 | Cipolla rossa lunga di Tropea | - | Di.SSPA |
TRO2 | Cipolla rossa tonda di Tropea | - | Di.SSPA |
MCO | Cipolla ramata di Montoro | - | Di.SSPA |
y Di.SSPA, Beşa Zanistên Axê, Nebat û Xwarinê, Zanîngeha Bari. |
Materyalên pelên ji 20 jenotîpên serê nifûsê hatine nimûnekirin û heya ku were bikar anîn di -80 °C de hatine hilanîn. Ji bo cureyên dewlemend-polysaccharide, wek A. cepa, gavên yekem ên rakirina polîsakkarîdê ji bo bidestxistina DNA-ya qalîteya baş girîng in, ji ber vê yekê şuştinên destpêkê di tampon STE (0.25 M sukroz, 0.03 M Tris, 0.05 M EDTA) wekî ku ji hêla hatî destnîşan kirin [52]. ADN-ya tevahî li gorî rêbaza CTAB hate derxistin [53] û di dawiyê de ew ji bo kalîte û berhevdanê ji hêla Nano Drop 2000 UV-vis spectrophotometer (ThermoScientific, Waltham, MA, USA) û 0.8% elektroforez gel agarose ve hate kontrol kirin.
SSR Analysis
16 EST-SSR kombînasyonên destpêkê yên ku ji hêla [54] û berê di lêkolînên cihêrengiya genetîkî de ji hêla ve hatî ceribandin [43] û [44] û 21 SSR genomîk [45-yek] ji bo nirxandina guncaviya wan hatin vekolandin (Tabloya Pêvek S4). Jenotîp bi karanîna rêbaza nîşankirina fluorescent a aborî hate kirin ku tê de dûvika M13 li her pêşbirkê SSR-ya pêşeroj tê zêdekirin. [56]. Miksên PCR di reaksiyonên 20 gL de hatine amadekirin ku tê de hene: 50 ng ji tevahî DNA, 0.2 mM tevliheviya dNTP, 1X tampon reaksiyonê PCR, 0.8 U ji DreamTaq DNA polymerase (Thermo Scientific, Waltham, MA, USA), 0.16 gM primerê berevajî , 0.032 gM primera pêşerojê ku bi rêzika M13 (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3'), û 0.08 gM a yekemek gerdûnî ya M13 ya ku bi rengên floransent FAM an NED hatî nîşankirin (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) hatî dirêj kirin. Reaksiyonên PCR-ê di termosîkletera SimpliAmp (Applied Biosystems, CA, USA) de bi şert û mercên jêrîn ji bo pirraniya cotên primeran pêk hatin: 94 °C ji bo 5 hûrdeman, 40 dewran li 94 °C ji bo 30 s, 58 °C. ji bo 45 s û 72 °C ji bo 45 s û dirêjbûna dawî li 72 °C ji bo 5 min. Wekî ku ji bo ACM446 û ACM449, PCR-ya danûstendinê bi 60 °C heta 55 °C li ser 10 dorhêlan, 30 dewran li 55 °C, li dûv dirêjkirina 5 hûrdeman li 72 °C hate sepandin. Berhemên PCR-ê di nav plakaya 96-kaniyê de hatin barkirin û bi 14 gL Hi-Di Formamide (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) û 0.5 gL GeneScan 500 ROX Size Standard (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) hatin tevlihev kirin. Amplicon bi navgîniya ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) makîneya rêzgirtina kapilaran ve hatin çareser kirin, ku li wir alel wekî hevserdest hatin destnîşankirin û bi karanîna Nermalava GeneMapper Guhertoya 3.7 ve hatin destnîşankirin.
Nermalava GenAlEx 6.5 [57] û Cervus 3.0.7 [58] ji bo texmînkirina hejmara alelan (Na), hejmara alelên bi bandor (Ne), heterozîgosîteya dîtbar (Ho), heterozîgosîteya çaverêkirî (He), naveroka agahdariya pirmorfîk (PIC), endeksa agahdariya Shannon (I), û nîşana rastkirinê (Fis) hatine bikar anîn. ) ji bo her cihê SSR.
Nirxandina Pirrengiya Genetîkî
Dabeşkirina hiyerarşîk a cûrbecûr genetîkî di nav û di nav nifûsa pîvazê de ji hêla GenAlEx 6.5 ve hate nirxandin. [57] bi riya analîzkirina variansa molekularî (AMOVA) bi 999 bootstrapping ji bo ceribandina girîngiyê. Wekî din, nermalava GenAlEx 6.5 hate bikar anîn da ku cihêrengiya di nav her nifûsê de bi hesabkirina navînî ya Ho, He, û Fis li ser hemî cîhên SSR-ê were texmîn kirin.
Struktura nifûsê ji hêla algorîtmaya kombûnê-based modela Bayesian ve ku di nermalava STRUCTURE v.2.3.4 de hatî bicîh kirin ve hate destnîşan kirin. [59]. Daneyên daneyan bi hejmarek komikên hîpotetîk (K) ve hate xebitandin, ji 1 heta 10-an, ji her nirxek K-yê deh ranên serbixwe danîn. Ji bo her rêvekirinê, bi mebesta verastkirina hevgirtina encaman, 100,000 serdema şewitandina destpêkê û 100,000 dubareyên Markov Chain Monte Carlo (MCMC) di bin modela tevlihevkirinê û frekansên alel ên serbixwe di nav gelan de hatin kirin. Bi îhtîmala herî mezin nirxa K bi pêkanîna rêbaza AK, ku ji hêla ve hatî destnîşan kirin, hate destnîşankirin [60], di bernameya web-based STRUCTURE HARVESTER [61]. Nifûsek takekesî ji komek taybetî re hate veqetandin dema ku hevrêziya endametiya wê (q-nirx) ji 0.7 bilindtir bû, wekî din ew ji bav û kalên tevlihev hate hesibandin.
Analîza hevrêziya bingehîn hate kirin da ku nimûneyên pêwendiya genetîkî di nav danûstendinên ku ji hêla matrixa dûrbûna genetîkî ya Nei ve hatî eşkere kirin (Tabloya Pêvek S5) were dîtin. Li ser bingeha frekansên alelê, dendrogramek dûrahiya genetîkî bi pêkanîna rêbaza koma cotê negirandî bi analîza koma navînên hejmarî (UPGMA) di nermalava POPTREEW de hate çêkirin. [62]. Bootstrapping hate sepandin da ku pêbaweriya di komkirina hiyerarşîk de binirxîne, 100 vesazkirina berhevoka daneyê destnîşan kir. Di dawiyê de, nermalava MEGA X [63] wekî nermalava xêzkirina daran hate bikar anîn.
Materyalên Pêvek: Ya jêrîn li ser înternetê hene http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. Tablo S1: Taybetmendiya morfolojîk a ampûlên ARO, MCO, û TRO. Tablo S2: Nîşaneyên heterozîgotî û sabîtkirinê yên ji bo zevîyên ARO û zevîyên TRO û MCO hatine hesibandin. Tablo S3: Nirxên hevberî yên parametreya Fpt. Tablo S4: Lîsteya SSR-yên ku di lêkolînê de hatine bikar anîn. Tabloya S5. Matrixa nifûsa cot a dûrbûna genetîkî ya Nei. Wêneyê S1: Nexşeya rêzê ya nirxên K bi Delta K-ya Evanno re diguhere.
Alîkarên Nivîskar: CL û LR lêkolîn kirin û ceribandinê sêwirandin; CL û PI analîzên nîşankerên molekulî pêk anîn; ARM û VZ ceribandinên zeviyê kirin; RM, SP, GR, û CL di analîzkirina daneyan de beşdar bûn; RM û CL destnivîs nivîsandin. Hemû nivîskaran guhertoya çapkirî ya destnivîsê xwendiye û qebûl kirine.
Fona Ev xebat ji hêla projeya Herêmî ya Pulyayê "Pirrengiya Biyolojîkî ya Cûreyên Sebze yên Apulî"-Programma di Sviluppo Rurale per la Puglia 2014-2020 ve hate fînanse kirin. Misura 10-Sottomisura 10.2; bide CUP H92C15000270002, Îtalya.
kirin: Pejirandin ji ber "Azienda Agricola Iannone Anna" û "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" ne ji bo peydakirina materyalên nebatî yên ku di ceribandinê de hatine bikar anîn.
Têkoşînên Balkêş: Nivîskaran ti nakokiyek berjewendiyê dibêjin.
Çavkanî
- 1. Stearn, WT Çend cureyên Allium têne zanîn? Kew Mag. 1992, 9,180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. Daneyên Îstatîstîkî yên FAO. Li serhêl peyda dibe: http://www.fao.org/2017 (di 8 Çile 2019 de gihîştiye).
- 3. Block, E. Kîmyaya sîr û pîvazê. Sci. Im. 1985, 252,114-119. [CrossRef]
- 4. Lee, B.; Jung, JH; Kim, Nirxandina HS ya pîvaza sor li ser çalakiya antîoksîdan a di mişkê de. Food Chem. Toxicol. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. Lee, SM; Moon, J.; Chung, JH; Cha, YJ; Shin, MJ Bandora ekstraktên pîvazê yên dewlemend-quercetin li ser tromboza arterialî ya di mişkan de. Food Chem. Toxicol. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. Yoshinari, O.; Shiojima, Y.; Igarashi, K. Bandorên li dijî qelewbûnê yên jêgirtina pîvazê di mişkên rûn ên şekirê zucker de. Nutriyan 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. Akash, MSH; Rehman, K.; Chen, S. Spice plant Allium cepa: Pêveka xwarinê ji bo dermankirina şekirê şekir 2. Kedî 2014, 30,1128-1137. [CrossRef] [PubMed]
- 8. Wang, Y.; Tian, WX; Ma, XF Bandorên Inhibitory of pîvaz (Allium cepa L.) derxistina li ser belavbûna hucreyên penceşêrê û adîpocytes bi navgîniya astengkirina sentaza asîda rûnê. Asian Pac. J. Cancer Prev. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. Lai, WW; Hsu, SC; Chueh, FS; Chen, YY; Yang, JS; Lin, JP; Lien, JC; Tsai, CH; Chung, JG Quercetin koçberî û dagîrkirina hucreyên kansera devkî ya mirovî ya SAS-ê bi astengkirina rêyên nîşana NF-kappaB û matrix metalloproteinase-2/-9 asteng dike. Anticancer Res. 2013, 33,1941-1950. [PubMed]
- 10. Nicastro, HL; Ross, SA; Milner, JA Sîr û pîvaz: Taybetmendiyên wan ên pêşîlêgirtina penceşêrê. Cancer Prev. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. Forte, L.; Torricelli, P.; Boanini, E.; Gazzano, M.; Rubinî, K.; Fînî, M.; Bigi, A. Taybetmendiyên antîoksîdan û tamîrkirina hestî ya hîdroksîpatîta fonksiyonelkirî ya quercetin: Lêkolînek hev-çandî ya hucreya endotelîal- osteoblast-osteoclast-endotelîal in vitro. Acta Biomater. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. Yamazaki, Y.; Iwasaki, K.; Mikamî, M.; Yagihashi, A. Belavkirina yanzdeh pêşgirên tamê, bermayên S-Alk(en)yl-L-cysteine, di heft sebzeyên Allium de. Food Sci. Technol. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. Block, E. Kîmyaya organosulfurê ya Genus Allium-Encamên ji bo kîmya organîk a kelûmê. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1992, 31,1135-1178. [CrossRef]
- 14. Griffiths, G.; Trueman, L.; Crowther, T.; Thomas, B.; Smith, B. Pîvaz-Ji tenduristiyê re feydeyek gerdûnî ye. Phytother. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. Schwimmer, S.; Weston, WJ Pêşveçûna enzîmê ya pîruvîk acîdê di pîvazê de wekî pîvanek tûjiyê. J. Agric. Food Chem. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. Ketter, CAT; Randle, WM Nirxandina Pungency di pîvazan de. Li Lêkolînên Tested ji bo Hînkirina Laboratory; Karcher, SJ, Ed.; Komeleya ji bo Perwerdehiya Laboratoriya Biyolojiyê (ABLE): New York, NY, USA, 1998; Cild 19, rûpel 177-196.
- 17. Hanelt, P Taxonomy, evolution, û dîrok. Li Onions and Allied Crops, Vol. I. Botanîk, Fîzolojî û Genetîk; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC Press: Boca Raton, FL, USA, 1990; rûpel 1-26.
- 18. Rabinowitch, HD; Currah, L. Allium Crop Science: Pêşketinên Dawî; Weşana CABI: Wallingford, UK, 2002.
- 19. Mallor, C.; Carravedo, M.; Estopanan, G.; Mallor, F. Taybetmendiya çavkaniyên genetîkî yên pîvazê (Allium cepa L.) ji navenda cihêrengiya navîn a spanî. Span. J. Agric. Res. 2011, 9,144-155. [CrossRef]
- 20. Ferioli, F.; D'Antuono, LF Nirxandina fenolîk û cysteine sulfoxides di germplazmaya pîvaz û şûşê ya herêmî de ji Italytalya û Ukrayna. Genet. Resource. Crop Evol. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. Petropoulos, SA; Fernandes, A.; Barros, L.; Ferreira, ICFR; Ntatsi, G. Danasîna morfolojîk, xurek û kîmyewî ya 'vatikiotiko', nîjada herêmî ya pîvazê ji Yewnanîstanê. Food Chem. 2015,182,156-163. [CrossRef]
- 22. Liguori, L.; Adiletta, G.; Nazzaro, F.; Fratianni, F.; Di Matteo, M.; Albanese, D. Taybetmendiyên biyokîmyayî, antîoksîdan û çalakiya antîmîkrobî ya cûrbecûr pîvazan li qada Deryaya Navîn. J. Xwarin Meas. Charact. 2019,13,1232-1241. [CrossRef]
- 23. Yoo, KS; Pike, L.; Crosby, K.; Jones, R.; Leskovar, D. Cûdahiyên di tûjbûna pîvazê de ji ber kulîlk, hawîrdora mezinbûnê, û mezinahiya gulikê. Sci. Hortic. 2006,110,144-149. [CrossRef]
- 24. Beesk, N.; Perner, H.; Schwarz, D.; George, E.; Kroh, LW; Rohn, S. Belavbûna quercetin-3, 4'-O-diglucoside, quercetin-4'-O-monoglucoside, û quercetin li deverên cûda yên ampûlê pîvazê (Allium cepa L.) ku ji hêla genotip ve hatî bandor kirin. Food Chem. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. Caruso, G.; Conti, S.; Villari, G.; Borrelli, C.; Melchionna, G.; Minutolo, M.; Russo, G.; Amalfitano, C. Bandorên dema veguheztinê û tîrêjiya nebatê li ser hilberîn, kalîte û naveroka antîoksîdan a pîvazê (Allium cepa L.) li başûrê Îtalyayê. Sci. Hortic. 2014,166,111-120. [CrossRef]
- 26. Perez-Gregorio, MR; Regueiro, J.; Simal-Gandara, J.; Rodrigues, AS; Almeida, DPF Zêdekirina nirxa lêzêde ya pîvazan wekî çavkaniyek flavonoîdên antîoksîdan: Vekolînek krîtîk. Crit. Rev. Food Sci. Nutr. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [PubMed]
- 27. Pohnl, T.; Schweiggert, RM; Carle, R. Bandora rêbaza çandiniyê û hilbijartina kulîlkê li ser karbohîdartên çareserker û prensîbên tûj ên di pîvazan de (Allium cepa L.). J. Agric. Food Chem. 2018, 66,12827-12835. [CrossRef] [PubMed]
- 28. Tedesco, I.; Karbon, V.; Spagnuolo, C.; Mînasî, P.; Russo, GL Nasname û hejmartina flavonoîdên ji du celebên îtalî yên başûrî allium cepa L., Tropea (pîvaza sor) û Montoro (pîvaza sifir), û kapasîteya wan a parastina erythrocytes mirovan ji stresa oksîdative. J. Agric. Food Chem. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. Villano, C.; Esposito, S.; Carucci, F.; Frusciante, L.; Carputo, D.; Aversano, R. Di pîvazê de jenotîpkirina bilind-rêveberî strukturên cihêrengiya genetîkî û SNP-yên agahdar ên ku ji bo mezinbûna molekulê kêrhatî ne diyar dike. Mol. Nîjad. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. Mercatî, F.; Longo, C.; Poma, D.; Aranîtî, F.; Lupini, A.; Mammano, MM; Fiore, MC; Abenavoli, MR; Sunseri, F Guhertoya genetîkî ya tomatoyek Italiantalî ya dirêj-refê (Solanum lycopersicum L.) berhevkirina bi karanîna SSR û taybetmendiyên fêkiyên morfolojîk. Genet. Resource. Crop Evol. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. Gonzalez-Perez, S.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Merino, F.; Taboada, A.; Rivera, A.; Pomar, F.; Perovic, D.; Silvar, C. Di berhevoka pîvazê de cihêrengiya genetîkî û taybetmendiyên kalîteyê vedikolin (Allium cepa L.) zevîyên ji bakur-rojavayê Spanya. Genetics 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. Lotti, C.; Iovieno, P.; Centomani, I.; Marcotrigiano, AR; Fanelli, V.; Mimiola, G.; Summo, C.; Pavan, S.; Ricciardi, L. Taybetmendiya genetîkî, biyo-agronomîk, û xurekiya kale (brassica oleracea L. var. acephala) cihêrengî li Apulia, başûrê Italytalya. Pirrjimar 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. Bardaro, N.; Marcotrigiano, AR; Bracuto, V.; Mazzeo, R.; Ricciardi, F.; Lotti, C.; Pavan, S.; Ricciardi, L. Analîzkirina genetîkî ya berxwedanê Orobanche crenata (Forsk.) li pea (Pisum sativum L.) xeta nizm-strigolakton. J. Plant Pathol. 2016, 98, 671-675.
- 34. Wako, T.; Tsukazaki, H.; Yaguchi, S.; Yamashita, K.; Îto, S.; Shigyo, M. Nexşekirina ciyên taybetmendiya jimareyî ji bo dema kelandinê di komkirina pîvazê de (Allium fistulosum L.). Euphytica 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. Daka, N.; Mukhopadhyay, A.; Paritosh, K.; Gupta, V.; Pental, D.; Pradhan, AK Nasnameya SSR-yên genic û avakirina nexşeyek pêwendiya SSR-ê li Brassica juncea. Euphytica 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. Anandhan, S.; Mote, SR; Gopal, J. Nirxandina nasnameya celebê pîvazê bi karanîna nîşankerên SSR. Seed Sci. Technol. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. Mitrova, K.; Svoboda, P.; Ovesna, J. Hilbijartin û pejirandina mîhengek nîşankerê ji bo cihêrengkirina cûreyên pîvazê ji Komara Çek. Çek J. Genet. Nijada nebatan. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Montemurro, C. Parastin û taybetmendiya biyolojîkî ya germplazma zeytûnê ya Apulî. Acta Hortic. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. Mallor, C.; Arnedo-Andres, A.; Garces-Claver, A. Nirxandina cihêrengiya genetîkî ya spanî allium cepa zevîyên ji bo çandina pîvazê bi karanîna nîşankerên mîkrosatelîtê. Sci. Hortic. 2014,170,24-31. [CrossRef]
- 40. Rivera, A.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Garcia-Ulloa, A.; Pomar, F.; Silvar, C. Nirxandina cihêrengiya genetîkî ya di pîvazê de (allium cepa L.) zevîyên ji bakur-rojavayê Spanya û berhevdana bi guherbariya Ewropî re. NZJ Crop Hortic. 2016, 44,103-120. [CrossRef]
- 41. De Giovanni, C.; Pavan, S.; Taranto, F.; Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Marcotrigiano, AR; Mangini, G.; Montemurro, C.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Guhertoya genetîkî ya berhevokek germplazma gerdûnî ya chickpea (Cicer arietinum L.) tevlêbûnên Italiantalî yên di xetereya erozyona genetîkî de jî hene. Physiol. Mol. Biol. Plants 2017, 23,197-205. [CrossRef]
- 42. Mazzeo, R.; Morgese, A.; Sonnante, G.; Zuluaga, DL; Pavan, S.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Di brokoli rabe de cihêrengiya genetîkî (Brassica rapa L. subsp. sylvestris (L.) Janch.) ji başûrê Îtalyayê. Sci. Hortic. 2019, 253,140-146. [CrossRef]
- 43. Jakse, M.; Martin, W.; McCallum, J.; Havey, M. Polîmorfîzma yek nucleotide, indels, û dûbarekirina rêzikên sade ji bo nasîna kultura pîvazê. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. McCallum, J.; Thomson, S.; Pither-Joyce, M.; Kenel, F. Analîza cihêrengiya genetîkî û pêşkeftina nîşankera polîmorfîzma yek-nukleotîdî ya di pîvaza ampûlê ya çandiniyê de li ser bingeha nîşankerên dûbarekirina rêza rêzika diyarkirî-tag-sade. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. Baldwin, S.; Pither-Joyce, M.; Wright, K.; Chen, L.; McCallum, J. Pêşxistina nîşankerên dubarekirina rêza sade ya genomîkî ya bihêz ji bo texmînkirina cihêrengiya genetîkî di nav û di nav pîvazê de (Allium cepa L.) nifûs. Mol. Nîjad. 2012, 30,1401-1411. [CrossRef]
- 46. DeWoody, JA; Honeycutt, RL; Nîşankerên Skow, LC Microsatellite di kewên dûvikên spî de. J. Hered. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [PubMed]
- 47. Xudadadî, M.; Hesenpenah, D. Pîvazê Îranî (Allium cepa L.) bersivên kultûran li ser depresyona hevjîniyê. World Appl. Sci. J. 2010,11, 426-428.
- 48. Abdou, R.; Bakasso, Y.; Saadou, M.; Baudoin, JP; Hardy, OJ Cihêrengiya genetîkî ya pîvazên Nîjer (Allium cepa L.) bi nîşankerên dubare yên rêzikên hêsan (SSR) têne nirxandin. Acta Hortic. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. Pavan, S.; Lotti, C.; Marcotrigiano, AR; Mazzeo, R.; Bardaro, N.; Bracuto, V.; Ricciardi, F.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Schiavulli, A.; et al. Komek genetîkî ya cihêreng di çîçika çandiniyê de ku ji hêla vedîtina nîşanker û genotîpkirina berfireh a genomê ve hatî eşkere kirin. Genoma nebatê 2017, 2017,10. [CrossRef]
- 50. Pavan, S.; Marcotrigiano, AR; Ciani, E.; Mazzeo, R.; Zonno, V.; Ruggieri, V.; Lotti, C.; Ricciardi, L. Genotyping-by-sequencing of a melon (Cucumis melo L.) berhevkirina germplazma ji navendek cihêrengiya duyemîn qalibên guheztina genetîkî û taybetmendiyên genomîk ên hewzên genê yên cihêreng ronî dike. BMC Genom. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. Di Rienzo, V.; Sion, S.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Montemurro, C.; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Boucheffa, S.; Tamendjarî, A.; Pasqualone, A.; et al. Herikîna genetîkî di nav nifûsa zeytûnan de di nav hewza Deryaya Navîn de. Peer J. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. Şivan, LD; McLay, TG Du protokolên mîkro-pîvana ji bo veqetandina DNA ji tevna nebatê ya dewlemend-polîsakarid. J. Plant Res. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. Doyle, JJ; Doyle, JL Veqetandina DNA ya nebatê ji tevna nû. Focus 1990,12,13-14.
- 54. Kuhl, JC; Cheung, F.; Qiaoping, Y.; Martin, W.; Zewdîe, Y.; McCallum, J.; Catanach, A.; Rutherford, P.; Sink, KC; Jenderek, M.; et al. Komek bêhempa ya ji 11,008 etîketên rêzikên diyarkirî yên pîvaz, rêzika diyarkirî û cûdahiyên genomîk ên di navbera rêzikên yekcot ên asparagales û poales de eşkere dike. Ellaneya Nebatan 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. Kim, HJ; Lee, HR; Hyun, JY; Stran, KH; Kim, KH; Kim, JE; Hur, CG; Pêşveçûna Harn, CH Marker ji bo ceribandina paqijiya genetîkî ya pîvazê bi karanîna SSR Finder. Koreyî J. Breed. Sci. 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. Rêbazek aborî ji bo nîşankirina fluorescent perçeyên PCR. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. Peakall, R.; Smouse, PE GenAlEx 6.5: Analîzkirina genetîkî li Excel. Nermalava genetîkî ya nifûsê ji bo hînkirin û lêkolînê: Nûvekirinek. Biyenformatics 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. Kalinowski, ST; Taper, ML; Marshall, TC Veguheztina ka bernameya komputerê CERVUS çawa xeletiya genotyping bicîh tîne, serkeftina di peywira bavîtiyê de zêde dike. Mol. Ecol. 2007,16,1099-1106. [CrossRef]
- 59. Pritchard, JK; Stephens, M.; Rosenberg, NA; Donnelly, Nexşeya Komeleya P. di nifûsên birêkûpêk de. Im. J. Hum. Genet. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. Evanno, G.; Regnaut, S.; Goudet, J. Tesbîtkirina hejmara komên kesan bi karanîna nermalavê STRUCTURE: Lêkolînek simulasyonê. Mol. Ecol. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. Earl, D.; VonHoldt, B. HARVESTER AVAKIRÎ: Malper û bernameyeke ji bo dîtina derana STRUCTURE û pêkanîna rêbaza Evanno. Conserv. Genet. Resource. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. Takezaki, N.; Nei, M.; Tamura, K. POPTREEW: Guhertoya malperê ya POPTREE ji bo avakirina darên nifûsê ji daneyên frekansa allel û hesabkirina hin hejmarên din. Mol. Biol. Evol. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. Kumar, S.; Stecher, G.; Li, M.; Knyaz, C.; Tamura, K. MEGA X. Analîza Genetîkî ya Pêşveçûn a Molecular li seranserê platformên komputerê. Mol. Biol. Evol. 2018, 35,1547-1549. [CrossRef]